长春税务学院起步于东北银行总行1948年创办的东北银行干部训练班，后期组建东北银行干部学校。1950年9月15日，东北银行总行在干部学校的基础上正式建立东北银行专门学校，这是新中国创建的第一所金融高等学校。1952年12月在全国高等院校调整时，学校改为长春银行学校，隶属于中国人民银行总行。
1958年5月，吉林省人民政府与中国人民银行总行协商，决定在长春银行学校基础上组建吉林财贸学院，1958年9月29日，吉林财贸学院成立，这是国家较早创建的普通本科财经院校之一。1992年5月，吉林财贸学院更名为长春税务学院，隶属于当时的国家税务局和后来的国家税务总局，这是国家第一所也是迄今唯一一所税务本科大学。20世纪80年代初和2004年学校先后两次被遴选为吉林省重点大学。
学校现有经济学、管理学、法学、文学、理学、工学六大学科门类，27个本科专业。 现有省级重点学科7个。学校1983年开始招收硕士研究生，现有二级学科硕士学位授权点18个，具有理论经济学和应用经济学一级学科硕士学位授予权；是国家工商管理硕士（MBA）培养单位。有吉林省高校人文社会科学重点研究基地2个。有国家级精品课程1门，省级精品课程10门。

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