我校前身为中国人民解放军第一军医大学，创建于1951年，1979年被确定为全国重点大学，2004年被批准为全国8所试办八年制医学教育的高等院校之一，2004年8月按照国务院、中央军委的命令，整体移交广东省，更名为南方医科大学。现有校本部、顺德校区等2个校区，占地面积219.44万m2，建筑面积164.88万m2。学校办学实力雄厚，近几年，我校在各高校排行榜中一直位居全国百强之列，中国校友会网大学评价课题组公布的2010年大学排行榜中我校位居第84位。2007年，我校以19个二级指标全优的优异成绩通过教育部本科教学工作水平评估，也是广东省两所获全优成绩的院校之一。

目前我校面向全国31个省、自治区、直辖市及港澳台地区招生。

办学规模：现有第一临床医学院、第二临床医学院、基础医学院、中医药学院、护理学院、生物技术学院、药学院、公共卫生与热带医学学院、生物医学工程学院、人文与管理学院、外国语学院、马克思主义学院、研究生学院、继续教育学院、国际教育学院、医学职业技术学院等17个学院。形成了由6所直属附属医院（南方医院、珠江医院、华瑞医院、江都医院、中西医结合医院、北滘医院）、以广东省人民医院等为代表的45家非直属附属医院和65家教学医院组成的医疗教学联盟。目前共开设了51个本科专业（含方向），其中6个为广东省名牌专业。学校现有全日制在校生18000多人，其中本科生13600人、专科生900多人、研究生3500多人、留学生600多人。

2012年，学校继续面向31个省（自治区、直辖市）及港澳台地区招收51个本科专业（含方向）新生3200名、1个专科专业新生300名。

学科建设：学科覆盖医学、理学、工学、文学、管理学、法学、经济学等7大学科门类。现有10个博士学位授权一级学科，7个博士后科研流动站，75个博士学位授权点，98个硕士学位授权点。7个国家特色专业，3个国家重点学科，2个国家重点培育学科。广东省“211工程”三期重点学科建设项目立项5个。拥有中医内科肾病学、中药制剂学、中医内科脑病学等5个国家中医药重点学科。拥有10个广东省重点学科，1个教育部工程研究中心，1个省部共建重点实验室，13个广东省重点实验室，3个广东省教育厅重点实验室。国家重点学科分别布局在3个一级学科，省级重点学科覆盖24个二、三级学科。

人才队伍：现有专业技术人员6000多人，其中具有高级专业技术职称1100多人。中国科学院和中国工程院院士3名，双聘院士2人，国家“973”项目首席科学家2名，国家教学名师、全国优秀教师和全国模范教师8人，国家千人计划2人、国家高端外国专家2人、长江学者4人、广东省领军人才2人，国家杰出青年基金获得者5人，“何梁何利奖”获得者3人，国家级教学团队2个，有54人次先后获全国优秀科技工作者、全国优秀教师等荣誉，有100多名专家教授分别担任全军和全国性学术组织理事、常委以上职务。博士生导师334名，硕士生导师854名，先后有人员133人享受国务院政府特殊津贴。

教学改革：“十五”以来，学校先后承担了包括国家“十五”、“十一五”教育科学规划项目和“世行贷款”项目在内的国家、军队和广东省教育研究课题93项。在多科性医科大学办学模式、实验教学改革、创新教育、教学质量保障、教学管理信息化建设、医学教育技术研究、科研促进教学、医学人文教育等方面进行了深入探索和改革实践。获得省部级以上优秀教学成果奖41项，研制的《医学通用题库》，获得军队优秀教学成果二等奖，在全国50多家院校推广使用。开发的教务管理软件《军队院校学籍管理系统》，被指定为全军和武警院校的教务管理系统。73项省部级二等奖以上科研成果（占“十五”以来总成果的58.87%）已经转化为教学资源直接服务本科教学；主编出版“十一五”规划等高水平教材11部，58项多媒体教材获省部级以上成果奖；目前建有8门国家精品课程，国家双语示范课程3门，国家实验教学中心2个，16门广东省精品课程、7个广东省实验教学示范中心；建设了44门PBL课程、54门双语课程、33个本科生创新教育基地。

科学研究：2000年以来，先后承担各类课题2738项，获得纵向课题经费8.6亿元，主持国家“973”项目4项，牵头承担“艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治”国家科技重大专项2项，参与“重大新药创制”国家科技重大专项课题6项，牵头承担国家科技支撑计划项目1项，主持国家“863”课题16项，获国家杰出青年基金4项，获“教育部创新团队”2个。2000年以来，学校以第一完成单位获国家自然科学二等奖1项，国家技术发明二等奖1项，国家科技二等奖8项，广东省科学技术突出贡献奖2项，广东省科技一等奖24项。 2000年以来，我校有5项科研成果7次入选国家公布的年度科技十大新闻，是广东省入选“十大新闻”最多的高校。学校科技查新工作站是国内首批获教育部认证的医学类部级查新工作站。根据科技部科技信息研究所公布的最新数据，我校国内论文产出2548篇，位居全国高校25名，在全国医药类高校名列第5位；侯凡凡教授的研究论文发表在国际最著名的临床类综合学术期刊《新英格兰医学》杂志，该杂志当年影响因子达到51.296，该成果被美国内科学年报评为“2006年内科学领域最重要的14项研究进展之一”。

医疗实力：卫生部国家临床重点专科11个,国家中医药管理局重点学(专)科7个,广东省临床重点专科17个,广东省医学重点专科7个,广东省医疗质量控制中心5个。拥有6所直属附属医院，展开床位5700张，第一临床医学院（南方医院）、第二临床医学院（珠江医院）都是高水平综合性教学医院。其中南方医院为全国百佳医院。在消化病内镜诊疗、肾病综合治疗、骨科疾病诊治、重型颅脑损伤救治、烧伤整形和危重新生儿、危急重症孕产妇救治、微创外科技术、心脑血管介入、围产医学、口腔医学、中西医结合临床等领域形成了明显的技术优势。南方医院惠侨科（惠侨楼）是国内开办最早、规模最大、收治海外病人最多的“涉外医疗中心”，被中央军委授予“模范医疗惠侨科”荣誉称号，并得到江泽民同志亲笔题词嘉勉。

产业开发: 自20世纪80年代以来，学校坚持以“科学技术是第一生产力”为指导思想，开创了全国高校产学研一体化先河，以自主研发的“三九胃泰”、“正天丸”、“无限极口服液”、 “尿毒清”等产品为基础，先后创建了深圳南方制药厂（三九集团前身）、南方李锦记营养保健品有限公司（现名无限极（中国）有限公司）、广州康臣药业有限公司等国际知名的医药企业。2004年转制地方以来，取得科技成果300余项，研制出国际上第一个SARS抗原检测试剂盒、国家Ⅰ类新药全氟丙烷人血白蛋白微球注射剂、f-PAX系统等重量级的科研产品并成功转化，在生物医药、保健食品、医疗器械、日用化工等多个医药相关领域新建立了东方药林、南方洁灵、一大国隆、南方美迦、宜诚数字医疗等一批校办高新技术企业。